Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4FO95754 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4FO95754 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4FO95754 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4FO95754 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms