Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRTAMO95727 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRTAMO95727 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRTAMO95727 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTAMO95727 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTAMO95727 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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