Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP4O95707 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP4O95707 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POP4O95707 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP4O95707 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP4O95707 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP4O95707 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP4O95707 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP4O95707 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP4O95707 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP4O95707 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP4O95707 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP4O95707 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP4O95707 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP4O95707 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP4O95707 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP4O95707 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP4O95707 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP4O95707 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP4O95707 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP4O95707 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP4O95707 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP4O95707 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP4O95707 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP4O95707 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP4O95707 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP4O95707 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP4O95707 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP4O95707 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP4O95707 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP4O95707 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP4O95707 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP4O95707 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP4O95707 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP4O95707 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP4O95707 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POP4O95707 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP4O95707 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP4O95707 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POP4O95707 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP4O95707 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP4O95707 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP4O95707 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POP4O95707 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP4O95707 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP4O95707 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POP4O95707 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP4O95707 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POP4O95707 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP4O95707 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP4O95707 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POP4O95707 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP4O95707 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP4O95707 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP4O95707 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP4O95707 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP4O95707 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP4O95707 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP4O95707 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP4O95707 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP4O95707 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP4O95707 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POP4O95707 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POP4O95707 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP4O95707 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP4O95707 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP4O95707 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP4O95707 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP4O95707 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP4O95707 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP4O95707 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP4O95707 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP4O95707 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP4O95707 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP4O95707 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP4O95707 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP4O95707 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP4O95707 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP4O95707 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms