Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCB11O95342 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCB11O95342 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB11O95342 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCB11O95342 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCB11O95342 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB11O95342 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms