Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFASCO94856 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFASCO94856 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFASCO94856 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFASCO94856 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFASCO94856 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFASCO94856 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFASCO94856 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFASCO94856 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFASCO94856 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFASCO94856 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFASCO94856 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NFASCO94856 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFASCO94856 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFASCO94856 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFASCO94856 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFASCO94856 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFASCO94856 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFASCO94856 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFASCO94856 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFASCO94856 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFASCO94856 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFASCO94856 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFASCO94856 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFASCO94856 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFASCO94856 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFASCO94856 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFASCO94856 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFASCO94856 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFASCO94856 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFASCO94856 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFASCO94856 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFASCO94856 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFASCO94856 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFASCO94856 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFASCO94856 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NFASCO94856 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NFASCO94856 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFASCO94856 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFASCO94856 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFASCO94856 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFASCO94856 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFASCO94856 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NFASCO94856 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFASCO94856 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFASCO94856 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFASCO94856 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFASCO94856 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NFASCO94856 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFASCO94856 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NFASCO94856 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFASCO94856 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFASCO94856 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NFASCO94856 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NFASCO94856 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFASCO94856 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFASCO94856 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFASCO94856 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NFASCO94856 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFASCO94856 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFASCO94856 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFASCO94856 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NFASCO94856 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFASCO94856 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFASCO94856 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NFASCO94856 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFASCO94856 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFASCO94856 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NFASCO94856 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NFASCO94856 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NFASCO94856 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NFASCO94856 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFASCO94856 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFASCO94856 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NFASCO94856 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFASCO94856 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFASCO94856 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFASCO94856 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFASCO94856 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFASCO94856 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFASCO94856 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NFASCO94856 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFASCO94856 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFASCO94856 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFASCO94856 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFASCO94856 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NFASCO94856 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NFASCO94856 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFASCO94856 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NFASCO94856 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NFASCO94856 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFASCO94856 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFASCO94856 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFASCO94856 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFASCO94856 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFASCO94856 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NFASCO94856 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFASCO94856 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFASCO94856 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NFASCO94856 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms