Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF254O75437 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF254O75437 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF254O75437 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF254O75437 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1215.7 ms