Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSPAN1O60635 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN1O60635 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TSPAN1O60635 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN1O60635 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN1O60635 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN1O60635 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN1O60635 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN1O60635 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN1O60635 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN1O60635 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN1O60635 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSPAN1O60635 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN1O60635 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN1O60635 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN1O60635 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN1O60635 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSPAN1O60635 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSPAN1O60635 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSPAN1O60635 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN1O60635 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN1O60635 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN1O60635 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN1O60635 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSPAN1O60635 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN1O60635 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN1O60635 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSPAN1O60635 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TSPAN1O60635 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSPAN1O60635 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSPAN1O60635 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms