Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR5O60602 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLR5O60602 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLR5O60602 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLR5O60602 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TLR5O60602 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR5O60602 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR5O60602 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR5O60602 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR5O60602 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR5O60602 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR5O60602 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR5O60602 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR5O60602 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR5O60602 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TLR5O60602 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR5O60602 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR5O60602 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR5O60602 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR5O60602 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR5O60602 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR5O60602 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR5O60602 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR5O60602 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR5O60602 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR5O60602 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR5O60602 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR5O60602 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR5O60602 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR5O60602 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR5O60602 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR5O60602 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR5O60602 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR5O60602 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR5O60602 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR5O60602 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR5O60602 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR5O60602 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR5O60602 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLR5O60602 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLR5O60602 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLR5O60602 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR5O60602 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR5O60602 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR5O60602 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR5O60602 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR5O60602 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR5O60602 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR5O60602 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR5O60602 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR5O60602 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR5O60602 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR5O60602 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR5O60602 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR5O60602 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR5O60602 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR5O60602 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR5O60602 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR5O60602 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR5O60602 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR5O60602 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR5O60602 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR5O60602 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TLR5O60602 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TLR5O60602 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR5O60602 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR5O60602 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR5O60602 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR5O60602 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR5O60602 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR5O60602 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR5O60602 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR5O60602 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR5O60602 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR5O60602 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR5O60602 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR5O60602 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR5O60602 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR5O60602 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR5O60602 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR5O60602 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR5O60602 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR5O60602 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR5O60602 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR5O60602 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR5O60602 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR5O60602 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR5O60602 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR5O60602 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR5O60602 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR5O60602 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR5O60602 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR5O60602 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TLR5O60602 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR5O60602 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR5O60602 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR5O60602 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR5O60602 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR5O60602 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TLR5O60602 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms