Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DFNA5O60443 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DFNA5O60443 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DFNA5O60443 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DFNA5O60443 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DFNA5O60443 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DFNA5O60443 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms