Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TIMM44O43615 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TIMM44O43615 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMM44O43615 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMM44O43615 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms