Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP8B1O43520 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATP8B1O43520 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP8B1O43520 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8B1O43520 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms