Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TREHO43280 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREHO43280 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TREHO43280 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TREHO43280 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TREHO43280 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TREHO43280 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TREHO43280 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TREHO43280 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TREHO43280 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TREHO43280 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TREHO43280 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TREHO43280 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TREHO43280 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREHO43280 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREHO43280 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREHO43280 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TREHO43280 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TREHO43280 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TREHO43280 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TREHO43280 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TREHO43280 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREHO43280 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREHO43280 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREHO43280 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TREHO43280 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TREHO43280 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TREHO43280 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREHO43280 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TREHO43280 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREHO43280 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TREHO43280 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREHO43280 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREHO43280 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREHO43280 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TREHO43280 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREHO43280 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREHO43280 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREHO43280 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREHO43280 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREHO43280 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TREHO43280 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TREHO43280 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREHO43280 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREHO43280 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREHO43280 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREHO43280 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREHO43280 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TREHO43280 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREHO43280 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREHO43280 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREHO43280 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TREHO43280 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TREHO43280 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TREHO43280 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREHO43280 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREHO43280 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREHO43280 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TREHO43280 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREHO43280 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREHO43280 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREHO43280 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREHO43280 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREHO43280 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TREHO43280 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREHO43280 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREHO43280 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TREHO43280 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREHO43280 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREHO43280 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREHO43280 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREHO43280 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TREHO43280 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TREHO43280 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREHO43280 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREHO43280 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREHO43280 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREHO43280 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TREHO43280 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREHO43280 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREHO43280 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TREHO43280 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREHO43280 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TREHO43280 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms