Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLOCKO15516 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLOCKO15516 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLOCKO15516 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLOCKO15516 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms