Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA5O15230 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA5O15230 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA5O15230 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA5O15230 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms