Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB6O15197 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EPHB6O15197 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHB6O15197 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB6O15197 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB6O15197 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 507.8 ms