Protein–RNA interactions for Protein: O14521

SDHD, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHDO14521 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHDO14521 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHDO14521 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHDO14521 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHDO14521 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDHDO14521 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHDO14521 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDHDO14521 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHDO14521 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHDO14521 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHDO14521 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHDO14521 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDHDO14521 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDHDO14521 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDHDO14521 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHDO14521 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHDO14521 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHDO14521 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHDO14521 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHDO14521 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHDO14521 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHDO14521 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHDO14521 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHDO14521 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHDO14521 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHDO14521 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHDO14521 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHDO14521 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHDO14521 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHDO14521 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHDO14521 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHDO14521 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHDO14521 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHDO14521 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHDO14521 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHDO14521 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHDO14521 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHDO14521 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHDO14521 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHDO14521 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHDO14521 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHDO14521 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHDO14521 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHDO14521 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHDO14521 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHDO14521 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHDO14521 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHDO14521 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHDO14521 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHDO14521 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHDO14521 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHDO14521 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHDO14521 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHDO14521 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHDO14521 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHDO14521 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHDO14521 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHDO14521 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHDO14521 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHDO14521 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHDO14521 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHDO14521 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHDO14521 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHDO14521 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHDO14521 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHDO14521 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHDO14521 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHDO14521 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHDO14521 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHDO14521 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHDO14521 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHDO14521 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHDO14521 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHDO14521 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHDO14521 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHDO14521 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHDO14521 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHDO14521 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHDO14521 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHDO14521 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHDO14521 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHDO14521 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDHDO14521 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHDO14521 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHDO14521 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHDO14521 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHDO14521 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHDO14521 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHDO14521 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHDO14521 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHDO14521 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHDO14521 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDHDO14521 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms