Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F3O00716 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F3O00716 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F3O00716 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F3O00716 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F3O00716 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F3O00716 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F3O00716 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F3O00716 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F3O00716 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F3O00716 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F3O00716 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F3O00716 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F3O00716 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F3O00716 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F3O00716 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F3O00716 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F3O00716 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F3O00716 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F3O00716 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F3O00716 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F3O00716 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F3O00716 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F3O00716 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F3O00716 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F3O00716 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F3O00716 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F3O00716 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F3O00716 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F3O00716 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F3O00716 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F3O00716 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F3O00716 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F3O00716 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F3O00716 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F3O00716 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F3O00716 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F3O00716 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F3O00716 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F3O00716 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F3O00716 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F3O00716 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F3O00716 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F3O00716 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F3O00716 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F3O00716 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F3O00716 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F3O00716 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F3O00716 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F3O00716 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F3O00716 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F3O00716 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F3O00716 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F3O00716 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F3O00716 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F3O00716 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F3O00716 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E2F3O00716 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E2F3O00716 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F3O00716 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F3O00716 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F3O00716 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F3O00716 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F3O00716 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F3O00716 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F3O00716 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F3O00716 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F3O00716 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F3O00716 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F3O00716 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F3O00716 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F3O00716 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F3O00716 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F3O00716 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F3O00716 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F3O00716 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F3O00716 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F3O00716 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F3O00716 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E2F3O00716 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F3O00716 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F3O00716 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F3O00716 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E2F3O00716 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F3O00716 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F3O00716 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F3O00716 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F3O00716 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F3O00716 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F3O00716 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F3O00716 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F3O00716 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F3O00716 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F3O00716 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F3O00716 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F3O00716 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F3O00716 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F3O00716 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F3O00716 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F3O00716 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms