Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVH48-1M5A8F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVH48-1M5A8F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERVH48-1M5A8F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms