Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2K7ER74 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2K7ER74 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2K7ER74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2K7ER74 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms