Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QR89 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QR89 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QR89 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
J3QR89 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
J3QR89 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
J3QR89 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
J3QR89 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QR89 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QR89 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QR89 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QR89 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QR89 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QR89 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
J3QR89 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QR89 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QR89 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QR89 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QR89 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
J3QR89 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QR89 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QR89 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QR89 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QR89 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
J3QR89 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QR89 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QR89 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QR89 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
J3QR89 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QR89 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QR89 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QR89 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QR89 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
J3QR89 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3QR89 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3QR89 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
J3QR89 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3QR89 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3QR89 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3QR89 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
J3QR89 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
J3QR89 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QR89 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QR89 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QR89 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QR89 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QR89 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
J3QR89 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QR89 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QR89 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
J3QR89 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QR89 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QR89 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QR89 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
J3QR89 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3QR89 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
J3QR89 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
J3QR89 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3QR89 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3QR89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3QR89 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3QR89 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QR89 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QR89 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QR89 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QR89 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QR89 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QR89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3QR89 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QR89 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QR89 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3QR89 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms