Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms