Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms