Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms