Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRDCB7Z8K6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRDCB7Z8K6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRDCB7Z8K6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRDCB7Z8K6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms