Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACOD1A6NK06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACOD1A6NK06 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACOD1A6NK06 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACOD1A6NK06 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms