Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A087X0B3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A087X0B3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
A0A087X0B3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A087X0B3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087X0B3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms