RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500025.2

CSTF3-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSTF3-AS1, Length 2,031 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.32■□□□□ 0.68
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ZBTB22O15209 634 aa15.22■□□□□ 0.03
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.82□□□□□ -0.04
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.71□□□□□ -0.05
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.71□□□□□ -0.05
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FKBP8Q14318 412 aa14.69□□□□□ -0.06
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SMARCA2P51531 1590 aa14.53□□□□□ -0.08
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NESP48681 1621 aa14.16□□□□□ -0.14
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CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.12□□□□□ -0.15
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.09□□□□□ -0.15
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ABCC8Q09428 1581 aa14.07□□□□□ -0.16
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CFTRP13569 1480 aa14.07□□□□□ -0.16
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KLHL34Q8N239 644 aa14.06□□□□□ -0.16
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 C14orf37Q86TY3 774 aa14.05□□□□□ -0.16
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FOXD1Q16676 465 aa14.03□□□□□ -0.16
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 ERCC6Q03468 1493 aa14□□□□□ -0.17
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.99□□□□□ -0.17
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.97□□□□□ -0.17
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.97□□□□□ -0.17
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PRDM2Q13029 1718 aa13.95□□□□□ -0.18
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.92□□□□□ -0.18
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SOGA1O94964 1423 aa13.89□□□□□ -0.19
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.86□□□□□ -0.19
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.85□□□□□ -0.19
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.84□□□□□ -0.19
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 SYNJ1O43426 1573 aa13.84□□□□□ -0.19
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.83□□□□□ -0.2
CSTF3-AS1-201ENST00000500025 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
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