RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469833.1

GLIS3-209, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 773 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-209ENST00000469833 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
GLIS3-209ENST00000469833 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.35□□□□□ -0.27
GLIS3-209ENST00000469833 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
GLIS3-209ENST00000469833 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
GLIS3-209ENST00000469833 FOXD1Q16676 465 aa10.86□□□□□ -0.67
GLIS3-209ENST00000469833 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.83□□□□□ -0.68
GLIS3-209ENST00000469833 ADRA2BP18089 450 aa10.39□□□□□ -0.75
GLIS3-209ENST00000469833 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.38□□□□□ -0.75
GLIS3-209ENST00000469833 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GLIS3-209ENST00000469833 MSH5O43196 834 aa10.07□□□□□ -0.8
GLIS3-209ENST00000469833 POTEDQ86YR6 584 aa9.77□□□□□ -0.85
GLIS3-209ENST00000469833 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.53□□□□□ -0.88
GLIS3-209ENST00000469833 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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GLIS3-209ENST00000469833 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GLIS3-209ENST00000469833 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.28□□□□□ -0.92
GLIS3-209ENST00000469833 KCNA4P22459 653 aa9.2□□□□□ -0.94
GLIS3-209ENST00000469833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.18□□□□□ -0.94
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GLIS3-209ENST00000469833 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.88□□□□□ -0.99
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GLIS3-209ENST00000469833 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
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GLIS3-209ENST00000469833 SLC4A2P04920 1241 aa8.6□□□□□ -1.03
GLIS3-209ENST00000469833 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.6□□□□□ -1.03
GLIS3-209ENST00000469833 RNF39Q9H2S5 420 aa8.6□□□□□ -1.03
GLIS3-209ENST00000469833 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GLIS3-209ENST00000469833 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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GLIS3-209ENST00000469833 ZBTB22O15209 634 aa8.44□□□□□ -1.06
GLIS3-209ENST00000469833 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.43□□□□□ -1.06
GLIS3-209ENST00000469833 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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GLIS3-209ENST00000469833 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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GLIS3-209ENST00000469833 APLP2Q06481 763 aa8.36□□□□□ -1.07
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GLIS3-209ENST00000469833 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GLIS3-209ENST00000469833 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.19□□□□□ -1.1
GLIS3-209ENST00000469833 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GLIS3-209ENST00000469833 ABCB7O75027 752 aa8.17□□□□□ -1.1
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GLIS3-209ENST00000469833 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.12□□□□□ -1.11
GLIS3-209ENST00000469833 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.11□□□□□ -1.11
GLIS3-209ENST00000469833 POLA2Q14181 598 aa8.09□□□□□ -1.11
GLIS3-209ENST00000469833 SLC24A1O60721 1099 aa8.06□□□□□ -1.12
GLIS3-209ENST00000469833 BICRAQ9NZM4 1560 aa8□□□□□ -1.13
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GLIS3-209ENST00000469833 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.98□□□□□ -1.13
GLIS3-209ENST00000469833 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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GLIS3-209ENST00000469833 FBLN2P98095 1184 aa7.9□□□□□ -1.14
GLIS3-209ENST00000469833 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.86□□□□□ -1.15
GLIS3-209ENST00000469833 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.82□□□□□ -1.16
GLIS3-209ENST00000469833 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
GLIS3-209ENST00000469833 OSCARQ8IYS5 282 aa7.82□□□□□ -1.16
GLIS3-209ENST00000469833 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.82□□□□□ -1.16
GLIS3-209ENST00000469833 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
GLIS3-209ENST00000469833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.77□□□□□ -1.17
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GLIS3-209ENST00000469833 SPDYE6P0CI01 402 aa7.72□□□□□ -1.17
GLIS3-209ENST00000469833 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.72□□□□□ -1.17
GLIS3-209ENST00000469833 FKBP8Q14318 412 aa7.7□□□□□ -1.18
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GLIS3-209ENST00000469833 CUX2O14529 1486 aa7.6□□□□□ -1.19
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GLIS3-209ENST00000469833 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.54□□□□□ -1.2
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GLIS3-209ENST00000469833 PITPNM1O00562 1244 aa7.52□□□□□ -1.21
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GLIS3-209ENST00000469833 POTEHQ6S545 545 aa7.49□□□□□ -1.21
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GLIS3-209ENST00000469833 PROM2Q8N271 834 aa7.43□□□□□ -1.22
GLIS3-209ENST00000469833 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GLIS3-209ENST00000469833 ERCC6Q03468 1493 aa7.42□□□□□ -1.22
GLIS3-209ENST00000469833 NCAPD3P42695 1498 aa7.39□□□□□ -1.23
GLIS3-209ENST00000469833 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.39□□□□□ -1.23
GLIS3-209ENST00000469833 NESP48681 1621 aa7.38□□□□□ -1.23
GLIS3-209ENST00000469833 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
GLIS3-209ENST00000469833 TRIM41Q8WV44 630 aa7.37□□□□□ -1.23
GLIS3-209ENST00000469833 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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