RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044385.13

Sgtb-201, Transcript of Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sgtb, Length 3,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgtb-201ENSMUST00000044385 NischQ80TM9 1593 aa28.99■■■□□ 2.23
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa28.37■■■□□ 2.13
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Abcc9P70170 1546 aa27.95■■■□□ 2.07
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Abcc8B2RUS7 1588 aa27.64■■■□□ 2.02
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Rhox8Q6VSS7 320 aa26.84■■□□□ 1.89
Sgtb-201ENSMUST00000044385 ScribQ80U72 1612 aa26.08■■□□□ 1.77
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Kdm5dQ62240 1548 aa25.54■■□□□ 1.68
Sgtb-201ENSMUST00000044385 NacadQ5SWP3 1504 aa25.41■■□□□ 1.66
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.4■■□□□ 1.66
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.33■■□□□ 1.65
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa24.99■■□□□ 1.59
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Baz1aO88379 1555 aa24.94■■□□□ 1.58
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.86■■□□□ 1.57
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Rtl1Q7M732 1744 aa24.73■■□□□ 1.55
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.49■■□□□ 1.51
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.45■■□□□ 1.5
Sgtb-201ENSMUST00000044385 BicraF8VPZ9 1578 aa24.39■■□□□ 1.5
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24.26■■□□□ 1.47
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Trim41Q5NCC3 630 aa24.22■■□□□ 1.47
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa24.17■■□□□ 1.46
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Cngb1E1AZ71 1325 aa23.93■■□□□ 1.42
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.69■■□□□ 1.38
Sgtb-201ENSMUST00000044385 CftrP26361 1476 aa23.64■■□□□ 1.38
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Sgtb-201ENSMUST00000044385 HrcG5E8J6 738 aa23.6■■□□□ 1.37
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa23.44■■□□□ 1.34
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Chic1Q8CBW7 227 aa23.43■■□□□ 1.34
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Golga3P55937 1487 aa23.38■■□□□ 1.33
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.37■■□□□ 1.33
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Gab3Q8BSM5 595 aa23.36■■□□□ 1.33
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa23.21■■□□□ 1.31
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23.18■■□□□ 1.3
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Frmpd1A2AKB4 1549 aa23.14■■□□□ 1.29
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Cep164Q5DU05 1446 aa23.08■■□□□ 1.28
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Il27Q8K3I6 234 aa23.07■■□□□ 1.28
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Wdr62Q3U3T8 1523 aa23.03■■□□□ 1.28
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa23.02■■□□□ 1.28
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.98■■□□□ 1.27
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Top2bQ64511 1612 aa22.95■■□□□ 1.26
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.92■■□□□ 1.26
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.91■■□□□ 1.26
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Fmn1Q05860 1466 aa22.83■■□□□ 1.24
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Npm2Q80W85 207 aa22.78■■□□□ 1.24
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Myt1lP97500 1187 aa22.72■■□□□ 1.23
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.6■■□□□ 1.21
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Cux2P70298 1426 aa22.6■■□□□ 1.21
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Zeb1Q64318 1117 aa22.55■■□□□ 1.2
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.53■■□□□ 1.2
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.49■■□□□ 1.19
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.46■■□□□ 1.19
Sgtb-201ENSMUST00000044385 TnnQ80Z71 1560 aa22.44■■□□□ 1.18
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa22.4■■□□□ 1.18
Sgtb-201ENSMUST00000044385 PtprkP35822 1457 aa22.34■■□□□ 1.17
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.34■■□□□ 1.17
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Cep162Q6ZQ06 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
Sgtb-201ENSMUST00000044385 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Mrc2Q64449 1479 aa22.22■■□□□ 1.15
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Grin2bQ01097 1482 aa22.2■■□□□ 1.14
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.18■■□□□ 1.14
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Shroom4Q1W617 1475 aa22.12■■□□□ 1.13
Sgtb-201ENSMUST00000044385 NrkQ9R0G8 1455 aa22.1■■□□□ 1.13
Sgtb-201ENSMUST00000044385 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Duox2A2AQ99 1517 aa22.09■■□□□ 1.13
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.07■■□□□ 1.12
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Arhgap35Q91YM2 1499 aa22.06■■□□□ 1.12
Sgtb-201ENSMUST00000044385 UbtfP25976 765 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Clip1Q922J3 1391 aa22.02■■□□□ 1.12
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.02■■□□□ 1.12
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Efcab5A0JP43 1406 aa22.01■■□□□ 1.11
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Kif21aQ9QXL2 1672 aa21.97■■□□□ 1.11
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.95■■□□□ 1.1
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Plb1Q3TTY0 1478 aa21.91■■□□□ 1.1
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa21.9■■□□□ 1.1
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.89■■□□□ 1.1
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.85■■□□□ 1.09
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.83■■□□□ 1.09
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Eea1Q8BL66 1411 aa21.81■■□□□ 1.08
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Lmod2Q3UHZ5 550 aa21.79■■□□□ 1.08
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Carmil1Q6EDY6 1374 aa21.76■■□□□ 1.07
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Map3k1P53349 1493 aa21.75■■□□□ 1.07
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Mier1Q5UAK0 511 aa21.74■■□□□ 1.07
Sgtb-201ENSMUST00000044385 SynmQ70IV5 1561 aa21.68■■□□□ 1.06
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Arap1Q4LDD4 1452 aa21.67■■□□□ 1.06
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa21.67■■□□□ 1.06
Sgtb-201ENSMUST00000044385 Disp1Q3TDN0 1521 aa21.65■■□□□ 1.06
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