RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 GSDMDP57764 484 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CREB5Q02930 508 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 DRP2Q13474 957 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ENPP2Q13822 863 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SQLEQ14534 574 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 NECTIN1Q15223 517 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 UGP2Q16851 508 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 KBTBD6Q86V97 674 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 AFAP1Q8N556 730 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SKA1Q96BD8 255 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 PKP2Q99959 881 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIS12Q9H081 205 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMP27Q9H306 513 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 DAPK2Q9UIK4 370 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CACNA1FO60840 1977 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 FSD2A1L4K1 749 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEIS2O14770 477 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPAN9O75954 239 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDPCPO95876 746 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2T7P0C7T2 308 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV4-31P0DP07 118 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPN3P20807 821 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDH3P22223 829 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MNDAP41218 407 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRIP1P48552 1158 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAX9P55771 341 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC8A3P57103 927 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRAPQ13588 217 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNAI3Q3KNW1 292 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELFN2Q5R3F8 820 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX38Q6PEX7 206 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SZRD1Q7Z422 152 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 RTN4RL2Q86UN3 420 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 P2RY8Q86VZ1 359 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP57Q86XR8 500 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP57L1Q8IYX8 460 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXD1Q8NHP7 514 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 AZIN2Q96A70 460 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 OLFM1Q99784 485 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIGQQ9BRB3 760 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDF4Q9BRK5 362 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPVLQ9H3G5 476 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 OPA3Q9H6K4 179 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERINC1Q9NRX5 453 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPHK1Q9NYA1 384 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRID1Q9ULK0 1009 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGAP14A8MT82 685 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 KPNA7A9QM74 516 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPHB6O15197 1021 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAMDEC1O15204 470 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 UGT1A4P22310 534 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 JAK1P23458 1154 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNASE1P24855 282 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMP12P39900 470 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 HNF4AP41235 474 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSRP3P50461 194 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 STAT2P52630 851 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAZP56270 477 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP10-3P60369 221 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 MS4A2Q01362 244 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHAF1BQ13112 559 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 ODF4Q2M2E3 257 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 XKR3Q5GH77 459 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT79Q5XKE5 535 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL27RAQ6UWB1 636 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAGAPQ8N103 731 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 APPL2Q8NEU8 664 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR11H4Q8NGC9 324 aa2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms