RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3gnt5Q8BGY6 376 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tspan12Q8BKT6 305 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PgghgQ8BP56 690 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mterf4Q8BVN4 346 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem161aQ8VCA6 480 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Micu1Q8VCX5 477 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NrarpQ91ZA8 114 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MpstQ99J99 297 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CatsperzQ9CQP8 194 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rcan2Q9JHG2 197 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss16Q9QXE5 509 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tyk2Q9R117 1184 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TesminQ9WTJ6 475 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ly6iQ9WU67 134 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plxna1P70206 1894 aa9.75□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7086A0A1W2P766 342 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rhox2fA2ANE0 191 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rdh8D3Z6W3 317 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gimd1E9PW74 217 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21800J3QMJ9 180 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phox2bO35690 314 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tap1P21958 724 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TecP24604 630 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Malt1Q2TBA3 832 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CenplQ3U3S3 329 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp974Q3UVF6 752 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akr1clQ3UXL1 322 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snta1Q61234 503 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MelkQ61846 643 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tead4Q62296 427 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CcncQ62447 283 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atg16l2Q6KAU8 623 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dennd5aQ6PAL8 1287 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dmtf1Q8CE22 761 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FevQ8QZW2 237 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr397Q8VEZ6 315 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1310Q8VF85 312 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Imp4Q8VHZ7 291 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chchd6Q91VN4 273 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mthfd1Q922D8 935 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep97Q9CZ62 856 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2200002D01RikQ9D809 114 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cry2Q9R194 592 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plin4O88492 1403 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mterf1bB9EJ57 379 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp780bE9Q2S6 806 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akain1G3UWD5 69 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FxnO35943 207 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PuraP42669 321 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtskP55097 329 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrpap1P55302 360 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 WasP70315 520 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il6stQ00560 917 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp607aQ3TQG9 686 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LchnQ3UHG7 455 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Opa3Q505D7 179 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igsf5Q7TSN7 370 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrtm2Q8BGA3 515 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Irak2Q8CFA1 622 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Thap1Q8CHW1 210 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8K039 155 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Timd2Q8R183 305 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q91V76 315 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 As3mtQ91WU5 376 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lims2Q91XD2 341 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem135Q9CYV5 458 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl34Q9D1R9 117 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GrifinQ9D1U0 144 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif4e3Q9DBB5 207 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dll4Q9JI71 686 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hs6st3Q9QYK4 470 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acot2Q9QYR9 453 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Insl5Q9WUG6 135 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PtprfA2A8L5 1898 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ect2lA0A140LIP2 953 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6592A2AHC7 168 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kpna4O35343 521 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Limk2O54785 638 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ldb2O55203 373 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Csn1s1P19228 313 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cst3P21460 140 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sox2P48432 319 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 StsP50427 624 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aarsd1Q3THG9 412 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmub2Q3V209 319 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MagixQ4KL35 324 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mef2dQ63943 514 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tas2r106Q7M724 308 aa9.74□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cadm2Q8BLQ9 435 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.2 ms