Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,94■■■■■ 4,3
Plxna1P70206 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Plxna1P70206 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Plxna1P70206 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,6■■■■□ 3,45
Plxna1P70206 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Plxna1P70206 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,81■■■■□ 3,32
Plxna1P70206 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Plxna1P70206 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Plxna1P70206 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Plxna1P70206 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Plxna1P70206 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Plxna1P70206 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Plxna1P70206 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Plxna1P70206 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Plxna1P70206 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Plxna1P70206 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Plxna1P70206 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,77■■■■□ 3
Plxna1P70206 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Plxna1P70206 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Plxna1P70206 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Plxna1P70206 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Plxna1P70206 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Plxna1P70206 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Plxna1P70206 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Plxna1P70206 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Plxna1P70206 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Plxna1P70206 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Plxna1P70206 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Plxna1P70206 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Plxna1P70206 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Plxna1P70206 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Plxna1P70206 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Plxna1P70206 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Plxna1P70206 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Plxna1P70206 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Plxna1P70206 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,64■■■□□ 2,81
Plxna1P70206 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Plxna1P70206 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Plxna1P70206 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Plxna1P70206 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Plxna1P70206 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Plxna1P70206 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Plxna1P70206 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,04■■■□□ 2,72
Plxna1P70206 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Plxna1P70206 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Plxna1P70206 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,89■■■□□ 2,69
Plxna1P70206 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Plxna1P70206 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Plxna1P70206 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,75■■■□□ 2,67
Plxna1P70206 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Plxna1P70206 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Plxna1P70206 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Plxna1P70206 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Plxna1P70206 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Plxna1P70206 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Plxna1P70206 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Plxna1P70206 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Plxna1P70206 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,39■■■□□ 2,62
Plxna1P70206 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Plxna1P70206 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Plxna1P70206 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Plxna1P70206 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Plxna1P70206 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Plxna1P70206 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Plxna1P70206 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Plxna1P70206 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Plxna1P70206 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Plxna1P70206 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Plxna1P70206 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Plxna1P70206 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Plxna1P70206 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Plxna1P70206 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Plxna1P70206 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Plxna1P70206 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Plxna1P70206 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Plxna1P70206 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Plxna1P70206 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Plxna1P70206 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Plxna1P70206 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Plxna1P70206 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Plxna1P70206 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Plxna1P70206 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Plxna1P70206 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Plxna1P70206 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Plxna1P70206 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Plxna1P70206 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Plxna1P70206 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Plxna1P70206 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Plxna1P70206 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Plxna1P70206 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Plxna1P70206 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Plxna1P70206 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Plxna1P70206 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Plxna1P70206 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Plxna1P70206 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Plxna1P70206 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Plxna1P70206 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Plxna1P70206 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Plxna1P70206 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Plxna1P70206 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms