Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CcncQ62447 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CcncQ62447 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CcncQ62447 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CcncQ62447 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CcncQ62447 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CcncQ62447 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CcncQ62447 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CcncQ62447 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CcncQ62447 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CcncQ62447 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CcncQ62447 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CcncQ62447 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CcncQ62447 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CcncQ62447 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CcncQ62447 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CcncQ62447 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CcncQ62447 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CcncQ62447 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CcncQ62447 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CcncQ62447 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CcncQ62447 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CcncQ62447 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CcncQ62447 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CcncQ62447 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CcncQ62447 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CcncQ62447 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CcncQ62447 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CcncQ62447 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CcncQ62447 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CcncQ62447 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CcncQ62447 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CcncQ62447 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CcncQ62447 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CcncQ62447 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CcncQ62447 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CcncQ62447 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CcncQ62447 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CcncQ62447 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CcncQ62447 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CcncQ62447 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CcncQ62447 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CcncQ62447 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CcncQ62447 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CcncQ62447 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CcncQ62447 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CcncQ62447 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CcncQ62447 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CcncQ62447 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CcncQ62447 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CcncQ62447 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CcncQ62447 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CcncQ62447 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CcncQ62447 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CcncQ62447 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CcncQ62447 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CcncQ62447 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CcncQ62447 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CcncQ62447 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CcncQ62447 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CcncQ62447 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CcncQ62447 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CcncQ62447 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CcncQ62447 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CcncQ62447 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CcncQ62447 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CcncQ62447 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CcncQ62447 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CcncQ62447 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CcncQ62447 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CcncQ62447 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CcncQ62447 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CcncQ62447 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CcncQ62447 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CcncQ62447 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CcncQ62447 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CcncQ62447 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CcncQ62447 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CcncQ62447 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CcncQ62447 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CcncQ62447 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CcncQ62447 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CcncQ62447 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CcncQ62447 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CcncQ62447 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CcncQ62447 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CcncQ62447 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CcncQ62447 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CcncQ62447 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CcncQ62447 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CcncQ62447 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CcncQ62447 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CcncQ62447 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CcncQ62447 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CcncQ62447 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CcncQ62447 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CcncQ62447 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CcncQ62447 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CcncQ62447 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CcncQ62447 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms