Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Cst3P21460 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Cst3P21460 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Cst3P21460 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cst3P21460 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cst3P21460 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Cst3P21460 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cst3P21460 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cst3P21460 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cst3P21460 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cst3P21460 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cst3P21460 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Cst3P21460 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cst3P21460 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cst3P21460 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Cst3P21460 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cst3P21460 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Cst3P21460 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Cst3P21460 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Cst3P21460 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Cst3P21460 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Cst3P21460 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Cst3P21460 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Cst3P21460 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Cst3P21460 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cst3P21460 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cst3P21460 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Cst3P21460 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cst3P21460 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Cst3P21460 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Cst3P21460 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cst3P21460 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cst3P21460 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cst3P21460 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Cst3P21460 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Cst3P21460 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Cst3P21460 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Cst3P21460 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Cst3P21460 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
Cst3P21460 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Cst3P21460 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cst3P21460 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Cst3P21460 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Cst3P21460 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Cst3P21460 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Cst3P21460 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Cst3P21460 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Cst3P21460 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Cst3P21460 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Cst3P21460 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Cst3P21460 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Cst3P21460 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cst3P21460 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Cst3P21460 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Cst3P21460 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Cst3P21460 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Cst3P21460 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Cst3P21460 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Cst3P21460 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Cst3P21460 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Cst3P21460 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Cst3P21460 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Cst3P21460 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Cst3P21460 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Cst3P21460 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Cst3P21460 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Cst3P21460 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Cst3P21460 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Cst3P21460 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Cst3P21460 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Cst3P21460 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Cst3P21460 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Cst3P21460 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Cst3P21460 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Cst3P21460 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Cst3P21460 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Cst3P21460 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Cst3P21460 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Cst3P21460 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Cst3P21460 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Cst3P21460 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Cst3P21460 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cst3P21460 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Cst3P21460 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Cst3P21460 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Cst3P21460 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Cst3P21460 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cst3P21460 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Cst3P21460 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cst3P21460 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Cst3P21460 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Cst3P21460 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cst3P21460 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cst3P21460 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cst3P21460 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cst3P21460 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cst3P21460 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cst3P21460 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cst3P21460 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cst3P21460 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,6 ms