Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Ldb2O55203 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ldb2O55203 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ldb2O55203 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ldb2O55203 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ldb2O55203 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ldb2O55203 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Ldb2O55203 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ldb2O55203 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ldb2O55203 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ldb2O55203 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ldb2O55203 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ldb2O55203 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Ldb2O55203 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ldb2O55203 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ldb2O55203 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ldb2O55203 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ldb2O55203 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ldb2O55203 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ldb2O55203 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ldb2O55203 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ldb2O55203 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ldb2O55203 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ldb2O55203 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ldb2O55203 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ldb2O55203 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ldb2O55203 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ldb2O55203 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ldb2O55203 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ldb2O55203 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ldb2O55203 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ldb2O55203 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ldb2O55203 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ldb2O55203 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ldb2O55203 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ldb2O55203 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ldb2O55203 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ldb2O55203 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ldb2O55203 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ldb2O55203 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ldb2O55203 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ldb2O55203 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ldb2O55203 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ldb2O55203 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ldb2O55203 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ldb2O55203 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ldb2O55203 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ldb2O55203 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ldb2O55203 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ldb2O55203 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ldb2O55203 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ldb2O55203 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ldb2O55203 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ldb2O55203 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ldb2O55203 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ldb2O55203 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ldb2O55203 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ldb2O55203 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ldb2O55203 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ldb2O55203 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ldb2O55203 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ldb2O55203 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ldb2O55203 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ldb2O55203 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ldb2O55203 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ldb2O55203 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ldb2O55203 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ldb2O55203 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ldb2O55203 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ldb2O55203 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ldb2O55203 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ldb2O55203 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ldb2O55203 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ldb2O55203 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ldb2O55203 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ldb2O55203 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ldb2O55203 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ldb2O55203 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ldb2O55203 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ldb2O55203 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ldb2O55203 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ldb2O55203 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ldb2O55203 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ldb2O55203 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ldb2O55203 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ldb2O55203 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ldb2O55203 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ldb2O55203 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ldb2O55203 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ldb2O55203 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ldb2O55203 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ldb2O55203 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms