Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Kpna4O35343 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kpna4O35343 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kpna4O35343 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kpna4O35343 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Kpna4O35343 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kpna4O35343 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Kpna4O35343 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Kpna4O35343 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Kpna4O35343 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Kpna4O35343 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Kpna4O35343 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kpna4O35343 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Kpna4O35343 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kpna4O35343 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kpna4O35343 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kpna4O35343 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Kpna4O35343 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kpna4O35343 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kpna4O35343 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kpna4O35343 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kpna4O35343 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kpna4O35343 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kpna4O35343 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kpna4O35343 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kpna4O35343 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kpna4O35343 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kpna4O35343 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Kpna4O35343 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kpna4O35343 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kpna4O35343 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kpna4O35343 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kpna4O35343 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kpna4O35343 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Kpna4O35343 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kpna4O35343 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kpna4O35343 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kpna4O35343 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kpna4O35343 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kpna4O35343 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kpna4O35343 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kpna4O35343 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kpna4O35343 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kpna4O35343 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kpna4O35343 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kpna4O35343 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Kpna4O35343 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kpna4O35343 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kpna4O35343 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kpna4O35343 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kpna4O35343 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kpna4O35343 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kpna4O35343 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kpna4O35343 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kpna4O35343 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kpna4O35343 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Kpna4O35343 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kpna4O35343 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kpna4O35343 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kpna4O35343 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kpna4O35343 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kpna4O35343 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kpna4O35343 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Kpna4O35343 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kpna4O35343 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Kpna4O35343 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kpna4O35343 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kpna4O35343 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kpna4O35343 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kpna4O35343 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kpna4O35343 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kpna4O35343 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kpna4O35343 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kpna4O35343 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Kpna4O35343 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kpna4O35343 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kpna4O35343 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kpna4O35343 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kpna4O35343 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kpna4O35343 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kpna4O35343 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kpna4O35343 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kpna4O35343 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kpna4O35343 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kpna4O35343 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kpna4O35343 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kpna4O35343 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kpna4O35343 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kpna4O35343 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kpna4O35343 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kpna4O35343 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kpna4O35343 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Kpna4O35343 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kpna4O35343 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kpna4O35343 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kpna4O35343 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kpna4O35343 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kpna4O35343 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kpna4O35343 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kpna4O35343 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms