Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Sox2P48432 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Sox2P48432 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sox2P48432 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sox2P48432 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox2P48432 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sox2P48432 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sox2P48432 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sox2P48432 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sox2P48432 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sox2P48432 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox2P48432 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sox2P48432 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sox2P48432 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox2P48432 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sox2P48432 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sox2P48432 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox2P48432 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox2P48432 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox2P48432 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sox2P48432 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Sox2P48432 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox2P48432 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sox2P48432 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sox2P48432 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sox2P48432 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sox2P48432 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sox2P48432 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sox2P48432 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox2P48432 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sox2P48432 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Sox2P48432 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sox2P48432 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sox2P48432 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox2P48432 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sox2P48432 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sox2P48432 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox2P48432 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox2P48432 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox2P48432 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox2P48432 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox2P48432 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox2P48432 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sox2P48432 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox2P48432 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sox2P48432 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox2P48432 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox2P48432 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox2P48432 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox2P48432 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox2P48432 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox2P48432 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox2P48432 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox2P48432 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox2P48432 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox2P48432 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox2P48432 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox2P48432 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox2P48432 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sox2P48432 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sox2P48432 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox2P48432 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sox2P48432 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sox2P48432 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sox2P48432 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox2P48432 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox2P48432 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox2P48432 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox2P48432 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox2P48432 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox2P48432 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sox2P48432 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sox2P48432 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sox2P48432 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sox2P48432 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sox2P48432 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sox2P48432 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sox2P48432 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sox2P48432 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox2P48432 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox2P48432 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox2P48432 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox2P48432 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox2P48432 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox2P48432 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox2P48432 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox2P48432 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox2P48432 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox2P48432 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox2P48432 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox2P48432 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox2P48432 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox2P48432 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox2P48432 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox2P48432 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox2P48432 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox2P48432 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox2P48432 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox2P48432 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox2P48432 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms