Protein–RNA interactions for Protein: Q9R117

Tyk2, Non-receptor tyrosine-protein kinase TYK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyk2Q9R117 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Tyk2Q9R117 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tyk2Q9R117 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tyk2Q9R117 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tyk2Q9R117 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Tyk2Q9R117 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tyk2Q9R117 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tyk2Q9R117 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tyk2Q9R117 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Tyk2Q9R117 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tyk2Q9R117 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tyk2Q9R117 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tyk2Q9R117 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tyk2Q9R117 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tyk2Q9R117 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tyk2Q9R117 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tyk2Q9R117 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Tyk2Q9R117 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tyk2Q9R117 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tyk2Q9R117 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tyk2Q9R117 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tyk2Q9R117 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tyk2Q9R117 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tyk2Q9R117 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tyk2Q9R117 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tyk2Q9R117 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tyk2Q9R117 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tyk2Q9R117 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tyk2Q9R117 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tyk2Q9R117 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tyk2Q9R117 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tyk2Q9R117 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tyk2Q9R117 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tyk2Q9R117 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tyk2Q9R117 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tyk2Q9R117 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tyk2Q9R117 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tyk2Q9R117 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tyk2Q9R117 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tyk2Q9R117 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tyk2Q9R117 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tyk2Q9R117 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tyk2Q9R117 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tyk2Q9R117 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tyk2Q9R117 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tyk2Q9R117 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tyk2Q9R117 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tyk2Q9R117 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tyk2Q9R117 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tyk2Q9R117 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tyk2Q9R117 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tyk2Q9R117 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tyk2Q9R117 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tyk2Q9R117 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tyk2Q9R117 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tyk2Q9R117 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tyk2Q9R117 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tyk2Q9R117 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tyk2Q9R117 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tyk2Q9R117 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tyk2Q9R117 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tyk2Q9R117 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tyk2Q9R117 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tyk2Q9R117 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tyk2Q9R117 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tyk2Q9R117 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tyk2Q9R117 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tyk2Q9R117 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tyk2Q9R117 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tyk2Q9R117 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tyk2Q9R117 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tyk2Q9R117 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tyk2Q9R117 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tyk2Q9R117 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tyk2Q9R117 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tyk2Q9R117 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tyk2Q9R117 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tyk2Q9R117 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tyk2Q9R117 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tyk2Q9R117 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tyk2Q9R117 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tyk2Q9R117 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tyk2Q9R117 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tyk2Q9R117 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tyk2Q9R117 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tyk2Q9R117 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tyk2Q9R117 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tyk2Q9R117 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tyk2Q9R117 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tyk2Q9R117 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tyk2Q9R117 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tyk2Q9R117 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tyk2Q9R117 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tyk2Q9R117 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tyk2Q9R117 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tyk2Q9R117 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tyk2Q9R117 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tyk2Q9R117 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tyk2Q9R117 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tyk2Q9R117 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms