RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm8444F6XS56 118 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r176G3UW31 304 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il1rnP25085 178 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hnf1bP27889 558 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Jak1P52332 1153 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ufm1P61961 85 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdk18Q04899 451 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr463Q5SW49 311 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr462Q5SW50 311 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NkaplQ5SZT7 395 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il1rapQ61730 570 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Syt14Q7TN84 555 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arhgef38Q80VK6 770 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prpf18Q8BM39 342 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atp6v1g3Q8BMC1 118 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Casp9Q8C3Q9 454 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q8C4P0 716 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gstm4Q8R5I6 218 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GatbQ99JT1 557 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ephx1Q9D379 455 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndel1Q9ERR1 345 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tuba8Q9JJZ2 449 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Psmd13Q9WVJ2 376 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mia3Q8BI84 1930 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mageb4A2A9R3 556 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klhl32A2AJX0 620 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Phf11A6H5X4 337 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mgat4eA6H684 439 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 FgaE9PV24 789 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r65G3X931 845 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hipk1O88904 1210 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lhx1P63006 406 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Psme2P97372 239 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wbp4Q61048 376 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 KdsrQ6GV12 332 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ptk7Q8BKG3 1062 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Akirin1Q99LF1 191 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dph2Q9CR25 489 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Moxd1Q9CXI3 613 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arl10Q9QXJ4 243 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc7a8Q9QXW9 531 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scnn1bQ9WU38 638 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm17175E9Q528 179 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ces2hF6Z9B9 558 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Serpinb9cI7HJI5 387 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf143O70230 638 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clec2lP0C7M9 211 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CidecP56198 239 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tuba4aP68368 448 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fmo5P97872 533 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mansc4Q3UU94 337 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clec12aQ504P2 267 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prss36Q5K2P8 849 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam46cQ5SSF7 391 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PtprnQ60673 979 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CcnhQ61458 323 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Armc1Q9D7A8 282 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dpp6Q9Z218 804 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm6685D3YYP3 228 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ifit3bE9PV48 403 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnf169E9Q7F2 694 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 JunbP09450 344 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atp1b2P14231 290 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gdf5P43027 495 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hnf4aP49698 474 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lman2lP59481 347 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrig1P70193 1091 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Padi2Q08642 673 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trim40Q3UWA4 246 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Runx1t1Q61909 577 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clic5Q8BXK9 251 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 B3gnt7Q8K0J2 397 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Eva1bQ8K2Y3 164 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdc16Q8R349 620 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vps4aQ8VEJ9 437 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Paip2bQ91W45 136 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 L3hypdhQ9CXA2 354 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CutalQ9D1U5 156 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clvs1Q9D4C9 354 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nusap1Q9ERH4 427 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PyglQ9ET01 850 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ninj2Q9JL89 143 aa8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clic1Q9Z1Q5 241 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1123A2AT85 323 aa8.31□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r238E9Q373 306 aa8.31□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tfap2aP34056 437 aa8.31□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Crhr1P35347 415 aa8.31□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Adra1bP97717 514 aa8.31□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fads2p1Q0VAX3 487 aa8.31□□□□□ -1.08
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms