Protein–RNA interactions for Protein: P09450

Junb, Transcription factor jun-B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunbP09450 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
JunbP09450 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
JunbP09450 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
JunbP09450 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
JunbP09450 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
JunbP09450 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
JunbP09450 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
JunbP09450 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
JunbP09450 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
JunbP09450 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
JunbP09450 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
JunbP09450 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
JunbP09450 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
JunbP09450 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
JunbP09450 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
JunbP09450 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
JunbP09450 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
JunbP09450 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
JunbP09450 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
JunbP09450 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
JunbP09450 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
JunbP09450 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
JunbP09450 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
JunbP09450 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
JunbP09450 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
JunbP09450 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
JunbP09450 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
JunbP09450 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
JunbP09450 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
JunbP09450 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
JunbP09450 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
JunbP09450 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,01■■■□□ 2,07
JunbP09450 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
JunbP09450 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
JunbP09450 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
JunbP09450 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
JunbP09450 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
JunbP09450 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
JunbP09450 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
JunbP09450 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
JunbP09450 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
JunbP09450 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
JunbP09450 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
JunbP09450 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
JunbP09450 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
JunbP09450 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
JunbP09450 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
JunbP09450 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
JunbP09450 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
JunbP09450 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
JunbP09450 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
JunbP09450 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
JunbP09450 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
JunbP09450 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
JunbP09450 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
JunbP09450 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
JunbP09450 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
JunbP09450 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
JunbP09450 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
JunbP09450 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
JunbP09450 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
JunbP09450 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
JunbP09450 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
JunbP09450 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
JunbP09450 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
JunbP09450 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
JunbP09450 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
JunbP09450 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
JunbP09450 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
JunbP09450 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
JunbP09450 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
JunbP09450 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
JunbP09450 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
JunbP09450 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
JunbP09450 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
JunbP09450 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
JunbP09450 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
JunbP09450 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
JunbP09450 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
JunbP09450 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
JunbP09450 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,44■■□□□ 1,82
JunbP09450 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
JunbP09450 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
JunbP09450 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,34■■□□□ 1,81
JunbP09450 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
JunbP09450 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
JunbP09450 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,24■■□□□ 1,79
JunbP09450 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
JunbP09450 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
JunbP09450 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
JunbP09450 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
JunbP09450 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
JunbP09450 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
JunbP09450 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
JunbP09450 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
JunbP09450 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
JunbP09450 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
JunbP09450 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,07■■□□□ 1,76
JunbP09450 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
JunbP09450 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,4 ms