Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tfap2aP34056 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tfap2aP34056 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tfap2aP34056 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tfap2aP34056 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Tfap2aP34056 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tfap2aP34056 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Tfap2aP34056 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tfap2aP34056 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tfap2aP34056 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tfap2aP34056 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tfap2aP34056 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tfap2aP34056 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tfap2aP34056 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tfap2aP34056 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tfap2aP34056 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tfap2aP34056 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tfap2aP34056 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tfap2aP34056 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tfap2aP34056 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tfap2aP34056 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tfap2aP34056 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tfap2aP34056 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tfap2aP34056 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tfap2aP34056 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tfap2aP34056 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tfap2aP34056 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tfap2aP34056 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tfap2aP34056 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tfap2aP34056 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tfap2aP34056 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tfap2aP34056 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tfap2aP34056 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tfap2aP34056 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tfap2aP34056 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tfap2aP34056 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tfap2aP34056 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tfap2aP34056 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tfap2aP34056 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfap2aP34056 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfap2aP34056 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfap2aP34056 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfap2aP34056 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tfap2aP34056 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tfap2aP34056 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tfap2aP34056 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tfap2aP34056 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfap2aP34056 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tfap2aP34056 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tfap2aP34056 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tfap2aP34056 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tfap2aP34056 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tfap2aP34056 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfap2aP34056 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tfap2aP34056 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfap2aP34056 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfap2aP34056 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tfap2aP34056 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tfap2aP34056 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tfap2aP34056 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tfap2aP34056 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tfap2aP34056 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tfap2aP34056 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tfap2aP34056 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tfap2aP34056 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tfap2aP34056 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tfap2aP34056 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tfap2aP34056 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfap2aP34056 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tfap2aP34056 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfap2aP34056 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tfap2aP34056 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tfap2aP34056 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tfap2aP34056 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfap2aP34056 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tfap2aP34056 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tfap2aP34056 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfap2aP34056 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfap2aP34056 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tfap2aP34056 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tfap2aP34056 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tfap2aP34056 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tfap2aP34056 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tfap2aP34056 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tfap2aP34056 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tfap2aP34056 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tfap2aP34056 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfap2aP34056 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfap2aP34056 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tfap2aP34056 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tfap2aP34056 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfap2aP34056 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tfap2aP34056 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfap2aP34056 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tfap2aP34056 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tfap2aP34056 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfap2aP34056 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tfap2aP34056 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tfap2aP34056 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tfap2aP34056 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms