Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAX3

Fads2p1, Fatty acid desaturase 2-like protein FADS2P1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fads2p1Q0VAX3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
Fads2p1Q0VAX3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Fads2p1Q0VAX3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Fads2p1Q0VAX3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Fads2p1Q0VAX3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Fads2p1Q0VAX3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Fads2p1Q0VAX3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Fads2p1Q0VAX3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Fads2p1Q0VAX3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Fads2p1Q0VAX3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Fads2p1Q0VAX3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Fads2p1Q0VAX3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Fads2p1Q0VAX3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Fads2p1Q0VAX3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Fads2p1Q0VAX3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Fads2p1Q0VAX3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fads2p1Q0VAX3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Fads2p1Q0VAX3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Fads2p1Q0VAX3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fads2p1Q0VAX3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fads2p1Q0VAX3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Fads2p1Q0VAX3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Fads2p1Q0VAX3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Fads2p1Q0VAX3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Fads2p1Q0VAX3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fads2p1Q0VAX3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Fads2p1Q0VAX3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fads2p1Q0VAX3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fads2p1Q0VAX3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fads2p1Q0VAX3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fads2p1Q0VAX3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Fads2p1Q0VAX3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Fads2p1Q0VAX3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fads2p1Q0VAX3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fads2p1Q0VAX3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fads2p1Q0VAX3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fads2p1Q0VAX3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fads2p1Q0VAX3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fads2p1Q0VAX3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fads2p1Q0VAX3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fads2p1Q0VAX3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Fads2p1Q0VAX3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Fads2p1Q0VAX3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fads2p1Q0VAX3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fads2p1Q0VAX3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Fads2p1Q0VAX3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fads2p1Q0VAX3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Fads2p1Q0VAX3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fads2p1Q0VAX3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Fads2p1Q0VAX3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fads2p1Q0VAX3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fads2p1Q0VAX3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Fads2p1Q0VAX3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fads2p1Q0VAX3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fads2p1Q0VAX3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fads2p1Q0VAX3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fads2p1Q0VAX3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fads2p1Q0VAX3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fads2p1Q0VAX3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fads2p1Q0VAX3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fads2p1Q0VAX3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fads2p1Q0VAX3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fads2p1Q0VAX3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fads2p1Q0VAX3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fads2p1Q0VAX3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fads2p1Q0VAX3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fads2p1Q0VAX3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fads2p1Q0VAX3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Fads2p1Q0VAX3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fads2p1Q0VAX3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Fads2p1Q0VAX3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fads2p1Q0VAX3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fads2p1Q0VAX3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fads2p1Q0VAX3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fads2p1Q0VAX3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fads2p1Q0VAX3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fads2p1Q0VAX3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Fads2p1Q0VAX3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fads2p1Q0VAX3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fads2p1Q0VAX3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fads2p1Q0VAX3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fads2p1Q0VAX3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Fads2p1Q0VAX3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Fads2p1Q0VAX3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fads2p1Q0VAX3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fads2p1Q0VAX3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fads2p1Q0VAX3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fads2p1Q0VAX3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fads2p1Q0VAX3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Fads2p1Q0VAX3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fads2p1Q0VAX3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Fads2p1Q0VAX3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fads2p1Q0VAX3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Fads2p1Q0VAX3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fads2p1Q0VAX3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fads2p1Q0VAX3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fads2p1Q0VAX3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fads2p1Q0VAX3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Fads2p1Q0VAX3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fads2p1Q0VAX3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1523.3 ms