Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Tuba4aP68368 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Tuba4aP68368 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tuba4aP68368 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tuba4aP68368 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tuba4aP68368 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Tuba4aP68368 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tuba4aP68368 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tuba4aP68368 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tuba4aP68368 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tuba4aP68368 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tuba4aP68368 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tuba4aP68368 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tuba4aP68368 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tuba4aP68368 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tuba4aP68368 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tuba4aP68368 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tuba4aP68368 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tuba4aP68368 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tuba4aP68368 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tuba4aP68368 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tuba4aP68368 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tuba4aP68368 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Tuba4aP68368 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tuba4aP68368 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tuba4aP68368 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tuba4aP68368 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tuba4aP68368 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tuba4aP68368 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tuba4aP68368 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tuba4aP68368 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tuba4aP68368 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tuba4aP68368 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tuba4aP68368 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tuba4aP68368 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tuba4aP68368 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tuba4aP68368 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tuba4aP68368 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tuba4aP68368 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tuba4aP68368 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tuba4aP68368 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tuba4aP68368 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tuba4aP68368 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tuba4aP68368 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tuba4aP68368 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tuba4aP68368 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tuba4aP68368 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tuba4aP68368 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tuba4aP68368 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tuba4aP68368 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tuba4aP68368 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tuba4aP68368 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tuba4aP68368 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tuba4aP68368 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tuba4aP68368 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tuba4aP68368 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tuba4aP68368 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tuba4aP68368 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tuba4aP68368 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tuba4aP68368 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tuba4aP68368 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tuba4aP68368 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tuba4aP68368 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tuba4aP68368 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tuba4aP68368 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tuba4aP68368 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tuba4aP68368 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tuba4aP68368 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tuba4aP68368 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tuba4aP68368 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tuba4aP68368 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tuba4aP68368 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tuba4aP68368 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tuba4aP68368 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tuba4aP68368 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tuba4aP68368 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tuba4aP68368 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tuba4aP68368 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tuba4aP68368 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tuba4aP68368 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tuba4aP68368 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tuba4aP68368 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tuba4aP68368 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tuba4aP68368 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tuba4aP68368 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tuba4aP68368 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tuba4aP68368 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tuba4aP68368 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tuba4aP68368 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tuba4aP68368 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tuba4aP68368 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tuba4aP68368 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tuba4aP68368 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms