Protein–RNA interactions for Protein: A2A9R3

Mageb4, Melanoma-associated antigen B4, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mageb4A2A9R3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Mageb4A2A9R3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Mageb4A2A9R3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Mageb4A2A9R3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Mageb4A2A9R3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Mageb4A2A9R3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Mageb4A2A9R3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Mageb4A2A9R3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mageb4A2A9R3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mageb4A2A9R3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Mageb4A2A9R3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mageb4A2A9R3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mageb4A2A9R3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mageb4A2A9R3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mageb4A2A9R3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mageb4A2A9R3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mageb4A2A9R3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mageb4A2A9R3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mageb4A2A9R3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Mageb4A2A9R3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mageb4A2A9R3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mageb4A2A9R3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mageb4A2A9R3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mageb4A2A9R3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mageb4A2A9R3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mageb4A2A9R3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mageb4A2A9R3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mageb4A2A9R3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mageb4A2A9R3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Mageb4A2A9R3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Mageb4A2A9R3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mageb4A2A9R3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mageb4A2A9R3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mageb4A2A9R3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mageb4A2A9R3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mageb4A2A9R3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mageb4A2A9R3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mageb4A2A9R3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Mageb4A2A9R3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mageb4A2A9R3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mageb4A2A9R3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mageb4A2A9R3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mageb4A2A9R3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mageb4A2A9R3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Mageb4A2A9R3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mageb4A2A9R3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mageb4A2A9R3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mageb4A2A9R3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mageb4A2A9R3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mageb4A2A9R3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mageb4A2A9R3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mageb4A2A9R3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mageb4A2A9R3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mageb4A2A9R3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mageb4A2A9R3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mageb4A2A9R3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mageb4A2A9R3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mageb4A2A9R3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mageb4A2A9R3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mageb4A2A9R3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mageb4A2A9R3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mageb4A2A9R3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mageb4A2A9R3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mageb4A2A9R3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mageb4A2A9R3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mageb4A2A9R3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mageb4A2A9R3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Mageb4A2A9R3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mageb4A2A9R3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mageb4A2A9R3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mageb4A2A9R3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mageb4A2A9R3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mageb4A2A9R3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mageb4A2A9R3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mageb4A2A9R3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mageb4A2A9R3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mageb4A2A9R3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mageb4A2A9R3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mageb4A2A9R3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mageb4A2A9R3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mageb4A2A9R3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mageb4A2A9R3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mageb4A2A9R3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mageb4A2A9R3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mageb4A2A9R3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Mageb4A2A9R3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mageb4A2A9R3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mageb4A2A9R3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mageb4A2A9R3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mageb4A2A9R3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mageb4A2A9R3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mageb4A2A9R3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mageb4A2A9R3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mageb4A2A9R3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mageb4A2A9R3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mageb4A2A9R3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mageb4A2A9R3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mageb4A2A9R3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mageb4A2A9R3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mageb4A2A9R3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms