Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Prpf18Q8BM39 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prpf18Q8BM39 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Prpf18Q8BM39 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Prpf18Q8BM39 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prpf18Q8BM39 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Prpf18Q8BM39 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Prpf18Q8BM39 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prpf18Q8BM39 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prpf18Q8BM39 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prpf18Q8BM39 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prpf18Q8BM39 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Prpf18Q8BM39 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prpf18Q8BM39 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prpf18Q8BM39 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prpf18Q8BM39 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prpf18Q8BM39 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prpf18Q8BM39 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prpf18Q8BM39 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Prpf18Q8BM39 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prpf18Q8BM39 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prpf18Q8BM39 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prpf18Q8BM39 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prpf18Q8BM39 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Prpf18Q8BM39 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf18Q8BM39 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prpf18Q8BM39 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prpf18Q8BM39 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prpf18Q8BM39 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prpf18Q8BM39 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prpf18Q8BM39 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prpf18Q8BM39 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prpf18Q8BM39 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prpf18Q8BM39 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf18Q8BM39 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf18Q8BM39 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prpf18Q8BM39 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prpf18Q8BM39 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf18Q8BM39 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Prpf18Q8BM39 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prpf18Q8BM39 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prpf18Q8BM39 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prpf18Q8BM39 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf18Q8BM39 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prpf18Q8BM39 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prpf18Q8BM39 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Prpf18Q8BM39 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prpf18Q8BM39 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prpf18Q8BM39 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prpf18Q8BM39 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prpf18Q8BM39 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpf18Q8BM39 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf18Q8BM39 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpf18Q8BM39 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prpf18Q8BM39 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpf18Q8BM39 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prpf18Q8BM39 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prpf18Q8BM39 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prpf18Q8BM39 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prpf18Q8BM39 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prpf18Q8BM39 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Prpf18Q8BM39 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prpf18Q8BM39 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpf18Q8BM39 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf18Q8BM39 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf18Q8BM39 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf18Q8BM39 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf18Q8BM39 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf18Q8BM39 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf18Q8BM39 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf18Q8BM39 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf18Q8BM39 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf18Q8BM39 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf18Q8BM39 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf18Q8BM39 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prpf18Q8BM39 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prpf18Q8BM39 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prpf18Q8BM39 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prpf18Q8BM39 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prpf18Q8BM39 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prpf18Q8BM39 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prpf18Q8BM39 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf18Q8BM39 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf18Q8BM39 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Prpf18Q8BM39 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf18Q8BM39 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf18Q8BM39 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prpf18Q8BM39 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf18Q8BM39 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf18Q8BM39 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prpf18Q8BM39 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf18Q8BM39 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf18Q8BM39 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf18Q8BM39 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf18Q8BM39 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf18Q8BM39 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf18Q8BM39 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf18Q8BM39 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf18Q8BM39 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf18Q8BM39 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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