RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 GSTT2P0CG29 244 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ITGB5P18084 799 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 20.9
SH3BP2-207ENST00000503393 NETO2Q8NC67 525 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SPATS1Q496A3 300 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PKP2Q99959 881 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 WNT7AO00755 349 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 RGL2O15211 777 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 FSHRP23945 695 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 FNDC8Q8TC99 324 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ATG13O75143 517 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 HSPA7P48741 367 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 DNASE1L2Q92874 299 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 HBEGFQ99075 208 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 GRIN3BO60391 1043 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 NDST3O95803 873 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 IL1BP01584 269 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 LCN1P31025 176 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 GPD2P43304 727 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SNX20Q7Z614 316 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 OXSMQ9NWU1 459 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 KRT33AO76009 404 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 GIMD1P0DJR0 217 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ZBTB26Q9HCK0 441 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 NUDT15Q9NV35 164 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 M0R036 132 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 RHDQ02161 417 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 VMACQ2NL98 169 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM17Q86X19 198 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PPEF2O14830 753 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 XPNPEP2O43895 674 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 LYPLA2O95372 231 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PORP16435 677 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 TMBIM6P55061 237 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PHOX2BQ99453 314 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 KLF11O14901 512 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 A0A075B6Q4 140 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ARPC2O15144 300 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 FECHP22830 423 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 NMBRP28336 390 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ENTPD1P49961 510 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 CXCL9Q07325 125 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 HEPACAMQ14CZ8 416 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 CPNE9Q8IYJ1 553 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PER2O15055 1255 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 AMD1P17707 334 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 AMBNQ9NP70 447 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 MYOM1P52179 1685 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SHPRHQ149N8 1683 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 INMTO95050 263 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 MMP27Q9H306 513 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 GNAO1P09471 354 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 PTPRAP18433 802 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 OR2T29Q8NH02 315 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 KAT2AQ92830 837 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-207ENST00000503393 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms