RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CPT1BQ92523 772 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 FGF21Q9NSA1 209 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 IL17BQ9UHF5 180 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 RARRES3Q9UL19 164 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 SNX12Q9UMY4 172 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ICKQ9UPZ9 632 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 BTRCQ9Y297 605 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 GSAPA4D1B5 854 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 IQCF5A8MTL0 148 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 MPP5Q8N3R9 675 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF843Q8N446 348 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CARD6Q9BX69 1037 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CDYLQ9Y232 598 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF185O15231 689 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PHF2O75151 1096 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 VAPBO95292 243 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TBR1Q16650 682 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 VRK3Q8IV63 474 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 P2RY12Q9H244 342 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 USP27XA6NNY8 438 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CES2O00748 559 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 GPC4O75487 556 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TPBGLP0DKB5 382 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CDH3P22223 829 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TUBB4BP68371 445 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TUBB2AQ13885 445 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 GPR19Q15760 415 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 KRT222Q8N1A0 295 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 EXD3Q8N9H8 876 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 SOHLH2Q9NX45 425 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 F8A1P23610 371 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 AOAHP28039 575 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 FNTAP49354 379 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 ARMC3Q5W041 872 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 MCUQ8NE86 351 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 POLG2Q9UHN1 485 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 C2orf74A8MZ97 194 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 NKX2-8O15522 239 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 MLNP12872 115 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 ST6GAL1P15907 406 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 SHMT2P34897 504 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 C19orf57Q0VDD7 668 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 MED8Q96G25 268 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 CROTQ9UKG9 612 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 NDUFS3O75489 264 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 SLCO2B1O94956 709 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 APOA4P06727 396 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.265e-7■□□□□ 8.4
HOXB3-202ENST00000460160 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 CASC4Q6P4E1 433 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC6Q86X45 466 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 STARD8Q92502 1023 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINB12Q96P63 405 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-202ENST00000460160 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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