RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261464.9

TRAF5-201, Transcript of TNF receptor associated factor 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF5, Length 3,972 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5-201ENST00000261464 ITGAXP20702 1163 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ATP6V1C1P21283 382 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PLA2G16P53816 162 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C2orf80Q0P641 193 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PDK3Q15120 406 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CPTPQ5TA50 214 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C16orf87Q6PH81 154 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KDELC1Q6UW63 502 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SLC39A13Q96H72 371 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CEP19Q96LK0 163 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TEX12Q9BXU0 123 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ALG2Q9H553 416 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SPACA6W5XKT8 324 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RASGRP1O95267 797 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 HSMCR30P0CW71 290 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CKMT2P17540 419 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PPP2R1BP30154 601 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 HMGCLP35914 325 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CCNFP41002 786 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SSR2P43308 183 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ERVFC1P60507 584 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 UFM1P61960 85 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 IRGCQ6NXR0 463 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ISCA2Q86U28 154 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 FBXO27Q8NI29 283 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KCNJ9Q92806 393 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SKA1Q96BD8 255 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RAB23Q9ULC3 237 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CCDC189A1A4V9 331 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 H3BN98 237 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 I6L893 689 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CD1DP15813 335 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TNNI3P19429 210 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KCNA5P22460 613 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 INPP1P49441 399 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SGSHP51688 502 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ACTR3P61158 418 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 NFKB2Q00653 900 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 OR4D1Q15615 310 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CGB2Q6NT52 195 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 AAGABQ6PD74 315 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 AMZ2Q86W34 360 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PHC3Q8NDX5 983 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PPCDCQ96CD2 204 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TMEM74Q96NL1 305 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KXD1Q9BQD3 176 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 NLNQ9BYT8 704 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C1orf109Q9NX04 203 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KLHL3Q9UH77 587 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 WASH3PC4AMC7 463 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 M0R3G1 203 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 OR1F1O43749 312 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SERPINI2O75830 405 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 G6PDP11413 515 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 AOC1P19801 751 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 IDSP22304 550 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CXCR2P25025 360 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GABRB3P28472 473 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RRM2P31350 389 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 MAGEA6P43360 314 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CLCNKAP51800 687 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms