RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587878.1

ATP9B-211, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), humanhuman

TSL 3

Gene ATP9B, Length 344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9B-211ENST00000587878 SHROOM2Q13796 1616 aa5.41□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 SMIM30A4D0T7 59 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 NEMP2A6NFY4 417 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 H0YGN5 161 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 VWA5AO00534 786 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 AP5Z1O43299 807 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 VEGFDO43915 354 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 SELENOFO60613 162 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 HMMRO75330 724 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 ALPPP05187 535 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 ALPPL2P10696 532 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 NAGAP17050 411 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 CD27P26842 260 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 CASP9P55211 416 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 PTENP60484 403 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 ZNF91Q05481 1191 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 FOXF2Q12947 444 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 HFEQ30201 348 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 CASC1Q6TDU7 716 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
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ATP9B-211ENST00000587878 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 RIT1Q92963 219 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 QRFPRQ96P65 431 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 HSD3B7Q9H2F3 369 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 POLE3Q9NRF9 147 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 FETUBQ9UGM5 382 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.4□□□□□ -1.54
ATP9B-211ENST00000587878 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.4□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 FAM149AA5PLN7 773 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 TMEM221A6NGB7 291 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 A6NNC1 897 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 ST8SIA3O43173 380 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 FCGR3BO75015 233 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 LDLRP01130 860 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 IGHV2-70P01814 119 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 FGBP02675 491 aa5.39□□□□□ -1.55
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ATP9B-211ENST00000587878 TCF4P15884 667 aa5.39□□□□□ -1.55
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ATP9B-211ENST00000587878 ASMTP46597 345 aa5.39□□□□□ -1.55
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ATP9B-211ENST00000587878 NPBWR1P48145 328 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 CLCNKAP51800 687 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 CUL3Q13618 768 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 GAMTQ14353 236 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 PDK1Q15118 436 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 MAPK11Q15759 364 aa5.39□□□□□ -1.55
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ATP9B-211ENST00000587878 TCTE1Q5JU00 501 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 LRRC38Q5VT99 294 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 NEK11Q8NG66 645 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 CCDC110Q8TBZ0 833 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 LPAR1Q92633 364 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 SGF29Q96ES7 293 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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ATP9B-211ENST00000587878 SNX25Q9H3E2 840 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 DPAGT1Q9H3H5 408 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 MYNNQ9NPC7 610 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 YIPF1Q9Y548 306 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.39□□□□□ -1.55
ATP9B-211ENST00000587878 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.39□□□□□ -1.55
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