RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538573.1

LINC02408-202, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2408, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC02408, Length 559 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC02408-202ENST00000538573 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 EPHX3Q9H6B9 360 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 EBF2Q9HAK2 575 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 OGFRQ9NZT2 677 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ATXN10Q9UBB4 475 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GRID1Q9ULK0 1009 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DMTF1Q9Y222 760 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DHRS7Q9Y394 339 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.1□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 THADAQ6YHU6 1953 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 A6NNZ2 444 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 F8W735 103 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KPNA5O15131 536 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GSC2O15499 205 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GRID2O43424 1007 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SGTAO43765 313 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TYROBPO43914 113 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 NUAK1O60285 661 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MAGEC1O60732 1142 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GLRA3O75311 464 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KLHL2O95198 593 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ZWINTO95229 277 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 APOA4P06727 396 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GSTA1P08263 222 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 COL6A2P12110 1019 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CHN1P15882 459 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CD9P21926 228 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 BCKDHBP21953 392 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KELP23276 732 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DGKAP23743 735 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CD27P26842 260 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MAOBP27338 520 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 AOAHP28039 575 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HTR1BP28222 390 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 AVPR2P30518 371 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HOXA6P31267 233 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CCR7P32248 378 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CRHR1P34998 444 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MAGEA12P43365 314 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GLRBP48167 497 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PRLHRP49683 370 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RGS4P49798 205 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CLCN7P51798 805 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 IL2P60568 153 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 YPEL5P62699 121 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 DLG1Q12959 904 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 MPP2Q14168 576 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 INSCQ1MX18 579 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LCE1DQ5T752 114 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 HHATQ5VTY9 493 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 C16orf46Q6P387 395 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 KLC3Q6P597 504 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ENPP7Q6UWV6 458 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 GCNT7Q6ZNI0 430 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 Q6ZSR6 202 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CCDC91Q7Z6B0 441 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 LONP2Q86WA8 852 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CFAP206Q8IYR0 622 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CCDC63Q8NA47 563 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 CD200R1Q8TD46 325 aa5.09□□□□□ -1.59
LINC02408-202ENST00000538573 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms